Manual

3.2 Ejecutando segmentación AI localmente

Puedes ejecutar la segmentación AI localmente, asegurando que ningún dato salga de tu sistema. Para hacerlo, instala TotalSegmentator en tu máquina. Para ello, primero debes instalar Python, PyTorch y añadir python al PATH. TotalSegmentator funciona en Ubuntu, macOS y Windows, y soporta tanto CPU como GPU. El rendimiento en GPU es significativamente más rápido.

3.2.1

Instalando Python

Si ya tienes Python en tu dispositivo, puedes omitir este paso.

¿Cómo comprobar si tienes Python instalado?

  1. Abre el símbolo del sistema.

  2. Escribe python --version

  3. Si está instalado, verás la versión instalada. Si no, aparecerá un mensaje como 'python' no se reconoce como un comando interno o externo.

¿Cómo instalar Python?

  1. Ve a Sitio web de descarga de Python.

  2. Encuentra la versión entre 3.7 y 3.13.

  3. Si está instalado, verás la versión instalada. Si no, aparecerá un mensaje como 'python' no se reconoce como un comando interno o externo.

  4. Asegúrate de seleccionar la casilla 'Agregar python.exe al PATH', y confirma que pip se instalará junto con Python (está incluido cuando eliges la opción 'Instalar ahora').

  5. Install python
  6. Instala Python.

  7. Puedes comprobar si está instalado correctamente siguiendo los pasos anteriores: ¿Cómo comprobar si tienes Python instalado?

Python en PATH

Es muy importante tener Python añadido a la variable ambiental PATH. Para ver si lo tienes en PATH, escribe ‘python’ en la línea de comandos. Si está añadido, se abrirá en la línea de comandos. Si no, aparecerá un mensaje como ‘python no se reconoce como una variable interna o externa. Mira aquí cómo añadir Python al PATH.

3.2.2

Instalando PyTorch

Si ya tienes PyTorch en tu dispositivo, puedes omitir este paso.

¿Cómo comprobar si tienes PyTorch instalado?

  1. Abre la línea de comandos.

  2. Escribe python

  3. Escribe import torch

  4. Escribe print(torch.__version__)

  5. Si está instalado, verás la versión instalada. Si no, aparecerá un mensaje como 'ModuleNotFoundError: No module named 'torch'.

¿Cómo instalar PyTorch?

  1. Ve a Sitio web de descarga de PyTorch.

  2. Elige la versión correcta de PyTorch según si quieres usar la versión CPU o CUDA (GPU).

  3. Copia (CTRL+C) el comando especificado en la sección Ejecutar este comando, por ejemplo pip3 install torch torchvision torchaudio --index-url https://download.pytorch.org/whl/cu118

  4. Abre la línea de comandos y pega el comando copiado.

  5. Instala PyTorch.

  6. Puedes comprobar si está instalado correctamente siguiendo los pasos anteriores: ¿Cómo comprobar si tienes PyTorch instalado?

3.2.3

Instalando TotalSegmentator

Si ya tienes TotalSegmentator en tu dispositivo, puedes omitir este paso.

¿Cómo instalar TotalSegmentator?

  1. Abre la línea de comandos.

  2. Escribe pip install TotalSegmentator==2.3.5.0

  3. Instala TotalSegmentator.

  4. Para verificar si TotalSegmentator está instalado correctamente, escriba en la línea de comandos TotalSegmentator -–version. Debería mostrar la versión instalada.

  5. Reinicia tu computadora para que TotalSegmentator esté disponible para otras aplicaciones, como Medicalholodeck.

  6. Ve a la configuración y permite mostrar modelos de segmentación locales.

  7. Install TotalSegmentator
  8. Una vez que todo esté instalado correctamente, las opciones de segmentación en Medicalholodeck aparecerán sin la nota de nube, indicando procesamiento local.